父母关系不合，准备分房和离，女儿13岁可以自主决定跟谁吗

是可以的。根据我国法律规定，离婚时抚养权的归属两周岁以下原则上跟母亲，两到八周岁的要综合考量双方的各种情况，进行综合判定。但八周岁以上的会尊重孩子的意愿。即便法院会从父母经济能力、学历、子女原生活环境、祖父母 / 外祖父母学历和抚养意愿等多方面因素进行评判，但是13周岁的孩子已经可以清晰明确表达自己的观念并且已经形成了基本的人生观和世界观，因此法院一般会尊重孩子的意愿。

法条依据：《民法典》第 1084 条：父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。